1.生石灰清塘法：
生石灰的消毒原理是利用氧化钙和水反应生成氢氧化钙，使水质呈强碱性，导致病微生物和野杂鱼虾难以存活而死亡，从而达到清塘消毒的目的。生石灰晴天用药效果更佳，不同消毒方法其使用量不同。干法清塘时每亩用量60—80kg；带水清塘时每亩每米水深用量—kg。
注意事项：
生石灰最好现买现用，因其长时间在空气暴露会吸收二氧化碳变成粉末状碳酸钙，起不到清塘消毒的作用，不便储存，生石灰需加浆后趁热泼洒，还需注意避免残渣倒入池中，以防池鱼误食导致死亡，使用方法较为繁琐，生石灰不可于漂白粉、强氯精等卤素类药物混用，因为漂白粉等为酸性药物，生石灰为碱性药物，若混用则酸碱中和，直接降低消毒功效。
2.漂白粉清塘法：
主要成分为次氯酸钙，氯化钙和氢氧化钙，作用于消毒的有效成分为次氯酸钙，其消毒作用就来源于次氯酸根的强氧化性。漂白粉中所含的过氧化钙在水中形成絮状沉淀，可吸附水中杂质，达到净水作用。漂白粉用于清塘消毒的用量一般为每立方米水用20g进行全塘泼洒，使用过后能够将池塘中的细菌、病毒等微生物以及其它的水生生物进行消杀。
注意事项：
稳定性差，在强光，高温，潮湿环境下易分解失效，使用后易残留，释放有毒的氯气对养殖生物造成危害，腐蚀性较强，若用量不合理可能对生物体表及腮部造成腐蚀;对病毒效果不佳。
3.二氧化氯清塘法：
二氧化氯在水产养殖中的产品一般为泡腾片，可迅速在水中溶解，释放出高纯度的二氧化氯气体，达到消毒杀菌的作用。其杀菌能力极强，作用速度快，放入水中10分钟内即可溶解，释放二氧化氯气体快速杀菌，杀菌能力不受水体pH影响，使用后无残留，且不会对养殖物产生致癌物质，使用前稳定性好，易于保存。二氧化氯用于清塘消毒每亩每米水深用量—g，使用方法便捷，成品泡腾片直接均匀投入水体即可，使用后可有效地杀死浮游生物，防止蓝绿藻大量滋生，达到清塘消毒目的。
注意事项：
会对藻类产生一定影响，若藻相不稳定可能会引发倒藻，会杀死有益菌，消毒后需注意补菌，放苗前建议试水。
4.茶粕清塘法：
水深1米时，用量为40—50kg/亩。先将茶粕捣碎，浸泡1天，选择晴天加水稀释后带渣全池泼洒。茶粕能杀灭杂鱼等，并能肥水，但不能杀死病菌。10天后药性消失。
注意事项：
茶粕小块必须泡开，以免沉底后造成以后死鱼；不使用变质茶粕。
5.巴豆清塘法：
水深30厘米时，用量为1.5～2.5kg/亩。把巴豆磨细，用30%的盐水浸泡2～3天，再用水稀释后连渣全池泼洒，能杀灭杂鱼等，并能肥水，但不能杀死病菌。7天后药性消失。
注意事项：
巴豆对人畜有害，所以在使用时要注意安全。
6.碳酸钠清塘法：
碳酸钠清塘也就是用碱粉清塘，通常是在干池时使用，用量为7.5g/立方米，碱粉化水，加水稀释后泼洒，使池水呈微碱性，可杀灭杂鱼和杂藻，同时有防出血病的作用。
注意事项：
碱粉不能和酸性药物同时使用。
7.氨水清塘法：
通常是在干池时使用，用量为12.5kg/亩，氨水含氮12.5%～20%。将氨水加水稀释后，均匀泼洒，使池水呈微碱性。
注意事项：
氨水宜现配现用，不可久放，时间一久容易挥发使效果降低。氨水有杀菌、虫及有害生物的作用，但不能杀死螺蛳。
8.过硫酸氢钾清塘法:
此类消毒产品的主要成分为过硫酸氢钾复合盐，与传统的氯制剂相比有诸多优点。杀菌范围广，见效快，可降解除草剂、藻毒素等有害物质，可降解氯制剂、碘制剂等消毒剂使用后的残留，络合和氧化重金属离子，使其形成无毒的稳定价态，提高池底氧化还原电位，抑制有害菌的繁殖，在池塘底部形成氧化表层，阻断底泥中有机质厌氧发酵产生的有毒害物质向水体发散。用量为每亩每米深水面添加g左右即可。
注意事项：有一定的杀藻作用，使用不当可能会出现倒藻，生产时具有较高的要求，导致市面上一些不合格产品的流通，使用时应选择大厂家生产的产品。